Forskere ved West China Hospital på Sichuan University har udviklet DNA-nanomaskiner, der kan detektere to ctDNA-mutationer samtidigt – uden DNA-amplifikation, enzymatiske reaktioner eller målmærkning. Dette rapporteres i tidsskriftet "Science Bulletin".
Nanostrukturerne består af selvsamlende DNA-strenge forbundet af sølv- eller kviksølvioner. Disse ioner fungerer som reportere, der genererer forskellige elektriske signaler. Når et passende DNA-mål binder sig, opløses strukturen og frigiver ionerne. Tilsætningen af methylenblåt som molekylært fyldstof undertrykte uspecifik ionlækage og reducerede baggrundssignalet: følsomheden steg 100 gange, og signal-støj-forholdet forbedredes 2,5 gange.
For EGFR-mutationerne L858R og T790M var detektionsgrænserne henholdsvis 5,2 og 6,0 amol/L. Plasmaprøver skal kun fortyndes og opvarmes; nukleinsyreekstraktion er ikke påkrævet. Målreaktionen tager 60 minutter. Hos 66 ubehandlede patienter med ikke-metastatisk ikke-småcellet lungekræft opnåede begge tests en AUC på 0,96 for at differentiere mellem qPCR-positive og -negative prøver. L858R-signalet opnåede 54,5 procents sensitivitet og 100 procents specificitet sammenlignet med 30 raske kontrolpersoner. På grund af sin lave prævalens i denne kohorte viste T790M kun en AUC på 0,52.
Platformen blev også tilpasset til BRAF V600E i papillær thyreoideacarcinom. I 38 patientprøver var overensstemmelsen med ARMS-qPCR 94,7 procent, og AUC var 0,97. Forskelle i mutationsassocierede signaler mellem metastatiske og ikke-metastatiske grupper tyder på potentiale for sygdomsovervågning. Forskerne anfører dog, at der er behov for større longitudinelle studier, der tager højde for tumorbyrde, sygdomsstadie og tidligere behandlinger.
