U tu svrhu, istraživači ISTA-e koristili su bezopasni virus vakcinije, koji je dostupan u laboratoriju, kao model virusa velikih boginja. Ispitali su cijele, zrele virione virusa vakcinije, kao i virusne jezgre izolirane i pročišćene iz njih – i to iz svakog mogućeg kuta.
„Kombinirali smo 'klasični' krio-EM s jednom česticom s krioelektronskom tomografijom, usrednjavanjem subtomograma i AlphaFold analizom kako bismo stvorili…“ Ukupno„Kako bi se dobio uvid u srž virusa malih boginja“, kažu istraživači.
Krioelektronska tomografija Omogućuje znanstvenicima stvaranje 3D volumena biološkog sustava. Kako bi se rekonstruirao uzorak do veličine cijelog virusa snimanjem slika uz postupno naginjanje uzorka, krioelektronska tomografija omogućila je postizanje nanometarske rezolucije za cijeli virus, njegovu jezgru i njegovu unutrašnjost.
Nadalje, istraživači su uspjeli uklopiti AlphaFold modele u promatrane podatke poput slagalice. Prilagođavanje oblika i identificiranje molekula, koji čine jezgru virusa malih boginja. Među njima, kandidat za jezgru proteina A10 istaknuo se kao jedna od najvažnijih komponenti.
Financiranje projekta:
Ovaj projekt financirala je inicijativa Chana Zuckerberga (DAF2021-234754 i DOI) https://doi.org/10.37921/812628ebpcwg) i Austrijski znanstveni fond (FWF) (P31445).
Izvorni publikacija:
Datler J, Hansen JM i dr. 2024. Multimodalni krio-EM otkriva trimere proteina A10 do formiraju palisadni sloj u jezgrama poksvirusa. Nature Structural & Molekularna biologija.
DOI: https://doi.org/10.1038/s41594-023-01201-6
Weitere Informationen:
https://ista.ac.at/de/forschung/schur-gruppe/ Schurova grupa na Institutu za znanost i tehnologiju Austrije (ISTA)
