四川大学華西病院の研究者らは、DNA増幅、酵素反応、標的標識化を必要とせずに、2つの循環腫瘍DNA（ctDNA）変異を同時に検出できるDNAナノマシンを開発した。この研究成果は、科学誌「サイエンス・ブレティン」に掲載された。
このナノ構造は、銀イオンまたは水銀イオンで連結された自己組織化DNA鎖から構成されています。これらのイオンはレポーターとして機能し、特有の電気信号を生成します。適切なDNA標的が結合すると、構造が崩壊してイオンが放出されます。分子充填剤としてメチレンブルーを添加することで、非特異的なイオン漏出が抑制され、バックグラウンド信号が低減されました。その結果、感度は100倍に向上し、信号対雑音比は2,5倍に改善されました。
EGFR変異L858RおよびT790Mの検出限界は、それぞれ5,2および6,0 amol/Lでした。血漿サンプルは希釈して加熱するだけでよく、核酸抽出は不要です。ターゲット反応には60分かかります。非転移性非小細胞肺癌の未治療患者66人において、両方の検査はqPCR陽性サンプルと陰性サンプルを区別するためにAUC 0,96を達成しました。L858Rシグナルは、30人の健常対照群と比較して、感度54,5%、特異度100%を達成しました。このコホートにおけるT790Mの有病率が低いため、AUCはわずか0,52でした。
このプラットフォームは、乳頭状甲状腺癌におけるBRAF V600E変異の検出にも適用されました。38人の患者サンプルにおいて、ARMS-qPCRとの一致率は94,7%、AUCは0,97でした。転移群と非転移群の間で変異関連シグナルに違いが見られたことから、疾患監視の可能性が示唆されました。しかし、研究者らは、腫瘍量、病期、および過去の治療歴を考慮した、より大規模な縦断的研究が必要であると述べています。
