За тази цел изследователите от ISTA използваха безвредния вирус на ваксината, който се предлага в лабораторията, като модел на поксвирус. Те изследваха цели, зрели вириони на вируса на ваксината, както и вирусни ядра, изолирани и пречистени от тях – буквално от всеки възможен ъгъл.
„Комбинирахме „класическата“ крио-ЕМ с единични частици с крио-електронна томография, осредняване на субтомограма и AlphaFold анализ, за да създадем…“ Като цяло„За да се получи представа за същността на вируса на едрата шарка“, казват изследователите.
Криоелектронна томография Това позволява на учените да създават 3D обеми на биологична система. За да се реконструира проба до размера на цял вирус чрез заснемане на изображения, докато пробата се накланя постепенно, криоелектронната томография позволи постигането на нанометрова резолюция за целия вирус, неговото ядро и вътрешността му.
Освен това, изследователите успяха да впишат моделите AlphaFold в наблюдаваните данни като пъзел. Напасване на форми и идентифициране на молекули, които формират ядрото на вируса на едрата шарка. Сред тях, кандидатът за основен протеин А10 се открои като един от най-важните компоненти.
Финансиране на проекта:
Този проект е подкрепен с финансиране от Инициативата на Чан Зукърбърг (DAF2021-234754 и DOI https://doi.org/10.37921/812628ebpcwg) и Австрийския научен фонд (FWF) (P31445).
Оригинална публикация:
Datler J, Hansen JM и др. 2024. Мултимодална крио-ЕМ разкрива тримери на протеин А10 до образуват палисаден слой в поксвирусни ядра. Nature Structural & Молекулярна биология.
DOI: https://doi.org/10.1038/s41594-023-01201-6
Weitere Informationen:
https://ista.ac.at/de/forschung/schur-gruppe/ Група Шур в Института за наука и технологии Австрия (ISTA)
