Das US-amerikanische Antimicrobial Resistance Laboratory Network (AR Lab Network) hat ein externes Qualitätssicherungsprogramm (External Quality Assessment, EQA) für die Whole-Genome-Sequenzierung (WGS) von Neisseria gonorrhoeae etabliert. Das Programm soll die Zuverlässigkeit genomischer Überwachungsdaten bei multiresistenten Gonokokken deutlich verbessern.
Die Studie, die in der Fachzeitschrift Microbiology Spectrum veröffentlicht wurde, beschreibt die Einführung des biannualen EQA-Programms ab Herbst 2020. Dabei erhalten vier regionale Labore des Netzwerks jeweils fünf verblindete Referenzisolate von Neisseria gonorrhoeae in dreifacher Ausführung. Die Labore führen sowohl eine Antibiotika-Resistenztestung als auch eine Whole-Genome-Sequenzierung durch. Die Daten werden anschließend an die Centers for Disease Control and Prevention (CDC) übermittelt und dort auf Taxonomie, Sequenzqualität, phylogenetische Analyse und Übereinstimmung mit phänotypischen Daten geprüft.
In den ersten Zyklen traten noch Qualitätsprobleme auf: Ein Labor erreichte in Zyklus 1 (2021) weniger als 80 Prozent der Punkte aufgrund unzureichender Sequenzabdeckung und schlechter Assemblierung. In einem späteren Zyklus führten Probenvertauschungen und niedrige Sequenzqualität bei zwei Laboren zu unzureichenden Ergebnissen. Solche Fehler wurden mithilfe von Multilocus-Sequenztypisierung (MLST) und Single-Nucleotide-Polymorphism-(SNP-)Distanzen zuverlässig erkannt.
Nach gezielten Korrekturmaßnahmen erreichten alle beteiligten Labore in den folgenden Zyklen (ab 2022 Zyklus 2) eine 100-prozentige Erfolgsquote. Das Programm deckte Workflow-Schwachstellen auf, die im Routinebetrieb nicht sichtbar gewesen wären, und trug so zu einer kontinuierlichen Verbesserung der Laborprozesse bei.
„Drug-resistant Neisseria gonorrhoeae wird von den CDC als ‚urgent threat‘ eingestuft“, betonen die Autoren. Zuverlässige genomische Überwachungsdaten sind entscheidend, um Resistenzmarker frühzeitig zu erkennen, Übertragungsketten nachzuverfolgen und die nationalen Behandlungsempfehlungen für Gonorrhö anzupassen.
Das EQA-Programm stellt sicher, dass die WGS-Daten aus den regionalen Laboren des AR Lab Network konsistent und von hoher Qualität sind. Es dient damit als wichtiges Instrument im Kampf gegen die Ausbreitung multiresistenter Gonokokken-Stämme.
Die Studie mit dem Titel „Establishing a Neisseria gonorrhoeae whole-genome sequencing external quality assessment for the Antimicrobial Resistance Laboratory Network (AR Lab Network) regional laboratories“ wurde am 21. Januar 2026 veröffentlicht.
https://doi.org/10.1128/spectrum.02256-25
