DOLPHIN enthüllt die verborgene Landschaft der Exon-Ebene-Variation in Einzelzellen
Ein revolutionärer Fortschritt in der Einzelzell-Transkriptomik verspricht, die Analyse von zellulären Prozessen auf ein neues Niveau zu heben: DOLPHIN, eine Methode, die Exon- und Junction-Read-Daten integriert, um feinkörnige transkriptomische Unterschiede sichtbar zu machen. Der Artikel „DOLPHIN Reveals the Hidden Landscape of Exon-Level Variation in Single Cells“ von Kailu Song, veröffentlicht am 18. August 2025 in der Nature Ecology & Evolution Community, beschreibt, wie diese Technologie die Grenzen herkömmlicher Gen-zentrierter Analysen überwindet und neue Einblicke in Krankheitsmechanismen und potenzielle Therapieansätze liefert. Die verborgenen Signale der Einzelzell-RNA-Sequenzierung Herkömmliche Einzelzell-RNA-Sequenzierung (scRNA-seq) reduziert Gene auf einzelne Zählwerte, wodurch ein Großteil der transkriptomischen Informationen ungenutzt bleibt. DOLPHIN hingegen arbeitet auf Exon-Ebene, indem es die Zusammenstellung von Transkripten in jeder Zelle modelliert und Verbindungen zwischen Exons durch Exon-Reads und Junction-Reads erfasst. Diese hochauflösende Methode generiert detailliertere Zellprofile, die feine Unterschiede in der alternativen Spleißung und biologischen…

