Boston – Menschen mit einer höheren Belastung durch veränderbare kardiovaskuläre Risikofaktoren wie Bluthochdruck, erhöhtes Cholesterin, Diabetes, Rauchen und Übergewicht weisen eine ausgedehntere Plaquebildung in den großen Herzkranzgefäßen auf. Zudem sind diese Plaques häufiger instabil und rupturgefährdet. Das zeigt eine Studie des Mass General Brigham Heart and Vascular Institute, die in JACC: Advances veröffentlicht wurde (DOI: 10.1016/j.jacadv.2026.102983). Die Forschenden untersuchten 534 Plaques in allen drei großen Koronararterien von 131 Patienten mithilfe der optischen Kohärenztomographie (OCT), einem hochauflösenden intravaskulären Bildgebungsverfahren. Sie verglichen den Einfluss veränderbarer und nicht veränderbarer Risikofaktoren (Alter, Geschlecht, familiäre Vorbelastung). Patienten mit mehr veränderbaren Risikofaktoren hatten insgesamt mehr Plaques in allen drei Gefäßen. Gleichzeitig fanden sich weniger stabile Plaques und häufiger vulnerable Merkmale wie lipidreiche Plaques mit dünner fibröser Kappe, die leichter reißen können. Nicht veränderbare Risikofaktoren waren dagegen eher mit stabileren Plaque-Phänotypen assoziiert. Nach Einschätzung der Autoren steigt… 

La Jolla – Forschende des Salk Institute und des Arc Institute haben den ersten körperweiten Einzelzell-Atlas erstellt, der zwei zentrale epigenetische Systeme – die dreidimensionale Genomfaltung und die DNA-Methylierung – in denselben Zellen misst. Die Studie wurde in der Fachzeitschrift Science veröffentlicht (DOI: 10.1126/science.adx0673). Jede Zelle des menschlichen Körpers trägt denselben DNA-Code. Welche Gene aktiv oder stumm sind, steuern epigenetische Markierungen und die räumliche Organisation des Genoms. Bislang waren DNA-Methylierung und 3-D-Genomstruktur nie gleichzeitig in Einzelzellen über den gesamten Körper erfasst worden. Der neue Atlas umfasst 86.689 Zellen aus 16 menschlichen Geweben und unterscheidet 35 Hauptzelltypen sowie 206 Untertypen. Er ist frei zugänglich unter http://humancellepigenomeatlas.arcinstitute.org/. Die Arbeit ist Teil des NIH-Programms 4D Nucleome. Die Forschenden identifizierten mehr als 1,36 Millionen differenziell methylierte Regionen und 283.606 differentielle Chromatinschleifen. Krankheitsassoziierte genetische Varianten – die meist in nicht-kodierenden Genomabschnitten liegen – ließen sich… 

Pittsburgh/Pittsburgh – Forschende der Carnegie Mellon University, der University of Pittsburgh und weiterer Institutionen haben Unterschiede in der dreidimensionalen Architektur des Genoms in Gehirnzellen von Alzheimer-Patienten nachgewiesen. Die Studie, veröffentlicht in der Fachzeitschrift Science (DOI: 10.1126/science.adz1652), verknüpft Genomfaltung mit Genaktivität und der räumlichen Organisation von Hirngewebe. Die Forschenden analysierten postmortales Gewebe aus dem präfrontalen Kortex von Personen mit und ohne Alzheimer-Erkrankung. Mit der Methode GAGE-seq erfassten sie in denselben Zellen sowohl die Genexpression als auch die dreidimensionalen Genomkontakte. Diese Daten kombinierten sie mit räumlichen Transkriptomkarten intakten Gewebes. Ein neu entwickeltes Deep-Learning-Modell namens Hicformer sagt anhand der DNA-Sequenz, globaler Faltungsmuster und lokaler Kontaktkarten die zelltypspezifische Genaktivität voraus. Es dient als rechnerisches Werkzeug, um den Einfluss veränderter Genomorganisation auf die Genregulation zu untersuchen. In Zellen von Alzheimer-Patienten zeigten sich aktive und inaktive Genomregionen (Kompartimente) weniger klar getrennt – ein Muster, das die…